Qual é a diferença entre ele não e ele não é?

A diferença é que "não" é uma contração que significa "não". Descreveria uma ação associada a ele. Então você usaria não ou não com um verbo: "Ele não dança". Ele não gosta de sorvete. "Ele não anda bem." "Ele não fala alto."

"Não é" seria usado para descrever ele e suas características. "Ele não é judeu." "Ele não é um homem muito alto." "Ele não está interessado em votar no republicano." "Ele não é um virgem." "Não é" é um estado de ser.